Sirkenin, sağlık üzerine olumlu etkileri de gün geçtikçe daha iyi anlaşılmıştır. Sağlık üzerine yararlı etkileri içeriğinde bulunan organik asitler, amino asitler, fenolik bileşikler ve melanoidinler gibi biyoaktif bileşiklerden kaynaklanmaktadır. Sirkede bulunan bu bileşiklerin antimikrobiyel, antioksidan, antidiyabetik, kardiyovasküler, antikarsinojenik, antitümör, antienfeksiyon etkilerinin olduğu belirlenmiştir. Ve çeşitli sağlık uygulamalarında kullanıldığı yapılan çalışmalar ışığında bildirilmektedir.
